Сведения о населении Южного Сахалина и Курил за 1945 год достаточно противоречивы. Это объяснимо, поскольку военное лихолетье в одночасье сорвало с обжитых мест многие тысячи людей. С другой стороны, быстрая смена властей и временное нарушение системы управления совсем не способствовали ведению четкого учета. По некоторым общим оценкам накануне войны здесь проживало около 400 тысяч человек гражданского населения. Часть жителей в период военных действий сами бежали на острова Японии. Кроме того, в дни наступления советских войск и до занятия ими всей территории Южного Сахалина, власти губернаторства Карафуто пытались провести эвакуацию гражданского населения. Называлась даже цифра эвакуированных на Хоккайдо -100-102 тысяч человек. Хотя, вероятно, на самом деле численность эвакуированных несколько меньше. По данным советского командования. В сентябре 1945 года на Южном Сахалине оставалось 370 тысяч жителей. В том числе - 358,5 тысяч японцев и 23,5 тысяч корейцев, а также 812 человек аборигенного населения - айнов, орочонов, эвенков и нивхов. Кроме них на Южном Сахалине проживало 360 русских. В основном это были потомки сахалинских первопоселенцев-каторжан.

Для поддержания спокойствия и порядка в городах Южного Сахалина создавались военные комендатуры. 27 августа 1945 года приступил к исполнению обязанностей военный комендант города Тоёхары генерал-майор М.В.Алимов, являвшийся заменителем командира 56-го стрелкового корпуса. В первую очередь военная комендатура взяла под охрану железнодорожный вокзал, здание губернаторства и важнейшие объекты жизнеобеспечения города. Это позволило предотвратить случаи диверсий и поджогов, сохранить от полного расхищения промышленные и торговые предприятия, банки, японские храмы, а также учреждения культуры - музей Карафуто, городскую библиотеку и т.д. Принимались меры по налаживанию хозяйственной деятельности японского населения Тоёхары, изъятию у частных лиц оружия, радиоаппаратуры и автотранспорта.